Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms