Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc4Q8BKW4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms