Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tubgcp5Q8BKN5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubgcp5Q8BKN5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Tubgcp5Q8BKN5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tubgcp5Q8BKN5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tubgcp5Q8BKN5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp5Q8BKN5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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