Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJW7

Eme1, Crossover junction endonuclease EME1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme1Q8BJW7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eme1Q8BJW7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eme1Q8BJW7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms