Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup93Q8BJ71 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms