Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdca8Q8BHX3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms