Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Clrn3Q8BHH8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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