Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmco3Q8BH01 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmco3Q8BH01 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms