Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
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Atg4dQ8BGV9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4dQ8BGV9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg4dQ8BGV9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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