Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Htatsf1Q8BGC0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htatsf1Q8BGC0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms