Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms