Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc50Q810U5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms