Protein–RNA interactions for Protein: Q80XG9

Lrrtm4, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 4, mousemouse

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm4Q80XG9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrrtm4Q80XG9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrrtm4Q80XG9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrrtm4Q80XG9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrrtm4Q80XG9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrrtm4Q80XG9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrrtm4Q80XG9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lrrtm4Q80XG9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrtm4Q80XG9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm4Q80XG9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrtm4Q80XG9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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