Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed4Q80WQ9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed4Q80WQ9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms