Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnupnQ80W37 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnupnQ80W37 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms