Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2eQ80UW8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms