Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms