Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rims3Q80U57 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rims3Q80U57 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms