Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Avl9Q80U56 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Avl9Q80U56 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Avl9Q80U56 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Avl9Q80U56 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Avl9Q80U56 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Avl9Q80U56 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Avl9Q80U56 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Avl9Q80U56 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Avl9Q80U56 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Avl9Q80U56 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms