Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc42bpbQ7TT50 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms