Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSV6

Got1l1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1l1Q7TSV6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Got1l1Q7TSV6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Got1l1Q7TSV6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms