Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec18aQ7TSQ1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clec18aQ7TSQ1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms