Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ClmQ7TSN2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClmQ7TSN2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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