Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek5Q7TSC3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nek5Q7TSC3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms