Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clec4b1Q7TS58 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clec4b1Q7TS58 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms