Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim46Q7TNM2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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