Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp397Q7TNK4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms