Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shq1Q7TMX5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shq1Q7TMX5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms