Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms