Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwistnbQ78WZ7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms