Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sys1Q78S06 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sys1Q78S06 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms