Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ubfd1Q78JW9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ubfd1Q78JW9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ubfd1Q78JW9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubfd1Q78JW9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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