Protein–RNA interactions for Protein: Q78JE5

Fbxo22, F-box only protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo22Q78JE5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fbxo22Q78JE5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo22Q78JE5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms