Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mindy1Q76LS9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mindy1Q76LS9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mindy1Q76LS9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms