Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SynmQ70IV5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SynmQ70IV5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms