Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35Q6ZWV7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms