Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SpopQ6ZWS8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms