Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Syne2Q6ZWQ0 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms