Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Topbp1Q6ZQF0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms