Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ssxb3Q6XAS4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb3Q6XAS4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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