Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc44a1Q6X893 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms