Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gja6Q6S5G4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms