Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nudcd1Q6PIP5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms