Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms