Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvoplQ6PDF3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms