Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trak1Q6PD31 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms