Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Lce3fQ6PAI4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms