Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp49Q6P9L4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp49Q6P9L4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms