Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms