Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc148Q6P5U8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc148Q6P5U8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms